Sau khi tốt nghiệp ở nước ngoài,[4] bà trở về Rwanda và làm giảng viên kinh tế tại Đại học Quốc gia Rwanda, từ năm 1999 đến 2003.[3] Từ năm 2003 đến 2008, bà là Bộ trưởng Bộ Nhà nước chịu trách nhiệm về Kế hoạch Kinh tế trong Bộ Tài chính và Kế hoạch Kinh tế Rwanda.[3] Từ năm 2008 đến năm 2011, bà là Bộ trưởng Bộ Thương mại và Bàng nghiệp trong nội các Rwandan.[3]

Là bộ trưởng bộ kế hoạch kinh tế, Tiến sĩ Monique Nsanzabaganwa có Bàng trong việc tạo ra một hệ thống thống kê và kế hoạch mạnh mẽ hơn trên toàn quốc và ở cấp địa phương. Bà là một nhà lãnh đạo của nỗ lực thành lập Viện Thống kê Quốc gia Rwanda. Bà cũng được ghi nhận là người dẫn đầu các nỗ lực thiết lập khung pháp lý và hướng dẫn chính sách cho tài chính vi mô ở Rwanda.[3]